W skrócie
W przeglądarce adnotujesz nagrania prawdziwych operacji: obrysowujesz narządy i narzędzia oraz zaznaczasz fazy zabiegu. Na tej adnotacji trenuje się i testuje modele widzenia komputerowego dla chirurgii.
Dla Ciebie to sposób, by zobaczyć setki operacji przed pierwszym dyżurem nocnym, sprawdzić swoją anatomię na prawdziwej tkance i zdobyć dane do pracy semestralnej, dyplomowej lub wystąpienia konferencyjnego.
Co zyskujesz
Prawdziwy projekt medycznej AI
To nie ćwiczenie z zajęć. To otwarty projekt badawczy. Pracujesz na tych samych zbiorach danych, z których korzystają zespoły badawcze na całym świecie – Cholec80, Endoscapes2023, AutoLaparo – w profesjonalnym narzędziu adnotacji, CVAT, według zasad jakości, jakich oczekują publikacje naukowe. Twoja adnotacja staje się częścią danych, na których modele się uczą i są testowane.
Kontakt z przypadkami
Cholecystektomia laparoskopowa to jedna z najczęstszych operacji w chirurgii ogólnej. W ciągu jednego semestru w projekcie obejrzysz dziesiątki takich operacji od początku do końca, od założenia trokarów po wydobycie pęcherzyka żółciowego.
Zobaczysz, jak ta sama operacja przebiega w różnych warunkach, jak wyglądają krwawienie, dym i zrosty oraz jak chirurg osiąga krytyczny widok bezpieczeństwa przed zaklipsowaniem przewodu. Żaden podręcznik nie daje takiej ilości, a pojedyncza wizyta na sali operacyjnej, gdzie widzi się głównie plecy zespołu, tym bardziej.
Anatomia z informacją zwrotną
Pierwsze zadania to zadania kalibracyjne: klatki, które mają już wzorcową adnotację ekspertów. Obrysowujesz pęcherzyk żółciowy, przewód pęcherzykowy i wątrobę i otrzymujesz raport, jak bardzo Twój obrys zgadzał się ze wzorcem dla każdej struktury.
To jak ćwiczenia z anatomii, w których każdy preparat ma dokładną odpowiedź – tyle że tkanka jest żywa i widziana przez laparoskop. Klatki sporne przegląda chirurg, kierownik kliniczny projektu, a decyzje trafiają do wspólnego dziennika, który może czytać każdy uczestnik.
Jak naprawdę działa medyczna AI
Prześledzisz całą drogę od klatki do modelu: jak zbiera się dane, dlaczego adnotatorzy muszą się zgadzać, jak model się uczy i dlaczego zawodzi.
Gdy w Twoim szpitalu pojawi się „inteligentny” asystent, będziesz wiedzieć, na jakich danych go trenowano i gdzie nie wolno mu ufać. Takiego krytycznego spojrzenia wkrótce będzie potrzebował każdy lekarz.
Umiejętność ceniona na rynku
Adnotowanie obrazów i wideo medycznego to odrębna kompetencja na styku medycyny i danych. Doświadczenie pracy według ścisłych wytycznych, z kontrolą jakości i metrykami zgodności, przydaje się w zespołach badawczych, w badaniach klinicznych i w firmach tworzących oprogramowanie medyczne.
Badania na prawdziwych danych
Badaniom studenckim zwykle brakuje danych: trzeba je zebrać, uzyskać zgody i zaadnotować. W tym projekcie ta praca jest wykonana lub trwa. Zebraliśmy ponad 50 tematów badawczych, od anatomii trójkąta Calota po to, jak bardzo adnotatorzy ufają automatycznym sugestiom.
Konferencje
Wyniki z projektu możesz przedstawiać na studenckich konferencjach naukowych i w sesjach młodych badaczy kongresów chirurgicznych i anatomicznych. Projekt pomaga w danych, metodach i przeglądzie Twojego streszczenia przed wysłaniem.
Uznanie
- Profil w serwisie na liście uczestników, za Twoją zgodą. Pokazuje Twoją rolę i liczbę godzin zaakceptowanej adnotacji.
- Współautorstwo publikacji projektu według tej samej zasady co dla każdego adnotatora: co najmniej 20 godzin zaadnotowanego i zaakceptowanego materiału, na podstawie umowy o wkładzie.
- Potwierdzenie udziału: na prośbę projekt pisze list opisujący Twoją rolę i ilość pracy, do portfolio, stypendium lub podania.
Publikacje i wystąpienia wzmacniają portfolio. Wiele uczelni zalicza je jako osiągnięcia indywidualne przy rekrutacji na rezydenturę i studia doktoranckie. Zasady zależą od uczelni i roku, więc sprawdź swoje.
Ludzie
Pracujesz obok chirurgów, inżynierów uczenia maszynowego i studentów z innych uczelni i miast. Te kontakty pomagają przy wyborze specjalizacji, rezydentury i promotora.
Jak to działa
- Zgłoś się. Napisz do nas: który rok, jaka uczelnia, co Cię interesuje.
- Wprowadzenie. Krótkie spotkanie online, wytyczne adnotacji i szkolenie z CVAT. Administrator zakłada Twoje konto; nie ma samodzielnej rejestracji.
- Kalibracja. Zadania na klatkach ze wzorcową adnotacją i raport, jak bardzo się z nią zgadzałeś.
- Prawdziwe zadania. Paczki po 50–100 klatek lub jedno wideo. Każdą paczkę przegląda druga osoba, a klatki sporne – chirurg.
- Własny temat. Opcjonalnie praca semestralna, dyplomowa lub wystąpienie z listy tematów albo z Twojego pomysłu.
Czas: około 2–4 godzin tygodniowo, kiedy Ci pasuje i z dowolnego miasta. Potrzebujesz komputera z przeglądarką i myszą; tablet graficzny jest wygodniejszy, ale niewymagany.
Kogo szukamy
- Studentów medycyny i pediatrii, którzy zaliczyli anatomię prawidłową człowieka.
- Studentów starszych lat i rezydentów zainteresowanych chirurgią, anatomią, radiologią lub informatyką medyczną.
- Studentów inżynierii biomedycznej i informatyki, do pracy na styku medycyny i danych.
Nie musisz umieć programować.
Co warto wiedzieć na początek
- Tylko dane otwarte i dozwolone. Projekt pracuje na opublikowanych, zdeidentyfikowanych zbiorach danych oraz na wideo, których autorzy wyrazili pisemną zgodę. Nigdy nie wgrywaj nagrań ze swojego szpitala ani praktyk, zdjęć pacjentów ani żadnych informacji o nich.
- Adnotacja to nie diagnoza. Twoje obrysy to dane badawcze. Ostatnie słowo w kwestii definicji medycznych ma kierownik kliniczny projektu.
- Wyłącznie do celów badawczych. Modele projektu nie są przeznaczone do leczenia pacjentów.
- Projekt dopiero startuje. Przygotowujemy dane i czekamy na zatwierdzenie wytycznych adnotacji; zadania pilotażowe zaczną się potem. To dobry moment, by dołączyć i znaleźć się w pierwszej grupie adnotatorów.
Jak dołączyć
Napisz na support@opensurgicalvision.org z tematem „Student: annotation” (po angielsku, by zespół mógł sortować pocztę) lub zostaw wiadomość w dyskusjach projektu.
Studiujesz informatykę? Masz własną stronę.
Jesteś nauczycielem akademickim i chcesz przyprowadzić grupę? Zobacz stronę dla nauczycieli akademickich i katedr.