Ce que le projet apporte à un département
Une plateforme de recherche prête
L’encadrement de la recherche étudiante achoppe souvent sur les données : il faut les collecter, les faire autoriser, les annoter et les vérifier. Dans ce projet, ce travail est fait ou en cours :
- des jeux de données chirurgicaux ouverts aux licences vérifiées ;
- l’outil d’annotation CVAT, déployé pour le projet ;
- une directive d’annotation approuvée par un chirurgien ;
- une méthode de contrôle qualité aux métriques claires.
Il vous reste ce pour quoi vous encadrez : la question, la méthode et la discussion des résultats.
Du matériel pédagogique
Les enregistrements d’opérations annotés sont des supports visuels pour l’anatomie topographique, la médecine opératoire et la chirurgie générale. Les structures sont délimitées et étiquetées sur de vraies images laparoscopiques, et les phases de l’opération sont marquées sur une frise chronologique. En cours, vous pouvez parcourir une cholécystectomie, de la pose des trocarts à l’extraction de la vésicule biliaire, et montrer à quoi ressemble la vue critique de sécurité.
Des publications pour le département
Des articles et des résumés communs sur des données ouvertes, avec une méthode reproductible. Les enseignants qui encadrent des étudiants et relisent des annotations deviennent cosignataires dans le cadre d’un accord de contribution.
Un rôle d’expert
Les chirurgiens et les anatomistes expérimentés peuvent affiner les définitions de classes, trancher les images litigieuses et relire la directive d’annotation. C’est la voie clinique.
Un contexte international
Des groupes de recherche du monde entier utilisent les jeux de données du projet. Les résultats de vos étudiants peuvent être comparés à des travaux publiés, ce qui est une bonne école de rigueur scientifique.
Un semestre dans le projet : un exemple de plan pour un groupe de recherche
| Semaines | Ce qui se passe | Résultat |
|---|---|---|
| 1–2 | Comment fonctionne l’IA médicale, éthique des données et licences, la directive d’annotation | Comptes CVAT, directive lue |
| 3–4 | Calibration sur des images dotées d’une annotation de référence | Un rapport sur la concordance de chaque étudiant avec la référence |
| 5–10 | Annotation réelle, relecture par les pairs, images litigieuses discutées avec un chirurgien | Heures d’annotation acceptées |
| 7–12 | Une petite étude sur l’un des sujets | Analyse, figures, limites |
| 13–16 | Rédaction d’un résumé et d’une communication | Un résumé pour un congrès étudiant |
Le plan peut être comprimé en un module de 4 à 6 semaines ou étalé sur une année universitaire se terminant par une thèse.
Façons de travailler ensemble
- Un groupe de recherche étudiant fondé sur le projet : trois étudiants ou plus sous votre direction.
- Travaux de cours et thèses à partir de la liste de sujets ou de vos propres idées.
- Travail commun avec des étudiants en informatique : l’étudiant en médecine porte le sens clinique, celui en informatique le modèle et le code. Les sujets en binôme figurent dans la liste.
- Un enseignement optionnel, « Intelligence artificielle en chirurgie », avec de l’annotation pratique ; nous pouvons concevoir ensemble le programme.
- Un partenariat universitaire : une convention de coopération. Voir la voie partenariats. Le nom d’une université n’apparaît sur le site qu’avec son autorisation écrite.
Ce que le projet prend en charge
- les comptes CVAT et la formation à l’outil ;
- des tâches prêtes à partir de données vérifiées et désidentifiées ;
- des métriques de qualité pour chaque étudiant : concordance avec la référence et accord avec les autres annotateurs ;
- la relecture clinique des cas litigieux ;
- des conseils sur les méthodes, les statistiques et le code d’analyse.
Ce qu’il faut convenir à l’avance
- Éthique. Le projet obtient un avis écrit distinct pour annoter des données ouvertes et désidentifiées. Si une étude comporte des enquêtes, des expériences pédagogiques ou l’analyse des propres résultats des étudiants, elle nécessite l’approbation du comité d’éthique de votre université et le consentement des participants.
- Licences. La plupart des jeux de données n’autorisent qu’un usage non commercial. L’enseignement et la recherche y entrent. Voir la page des licences.
- Reconnaissance. Seule l’université peut comptabiliser le travail dans le projet comme un stage ou comme un travail de recherche. Sur demande, le projet atteste le volume et la qualité du travail de chaque étudiant.
Comment commencer
Écrivez à support@opensurgicalvision.org avec l’objet « Department: cooperation » (en anglais, pour que l’équipe puisse trier les messages). Indiquez l’université, le département, à peu près combien d’étudiants et quel format vous intéresse. Nous vous répondrons et proposerons un créneau pour une courte réunion en ligne.
Les étudiants qui souhaitent participer par eux-mêmes ont leur propre page. Enseignants d’universités techniques : consultez la section de la page pour les étudiants en informatique.