FÜR LEHRENDE

Für Lehrende und Fachbereiche der Medizin

Eine fertige Grundlage für eine studentische Forschungsgruppe, Seminararbeiten und Abschlussarbeiten: offene Daten, ein Annotationswerkzeug, eine Methode zur Qualitätskontrolle und gemeinsame Publikationen.

Diese Seite wird noch von unseren wissenschaftlichen, klinischen und rechtlichen Fachleuten geprüft. Sie beschreibt Pläne, keine abgeschlossene Arbeit.

Was das Projekt einem Fachbereich bietet

Eine fertige Forschungsplattform

Die Betreuung studentischer Forschung scheitert oft an den Daten: Sie müssen erhoben, genehmigt, annotiert und geprüft werden. In diesem Projekt ist diese Arbeit erledigt oder im Gange:

  • offene chirurgische Datensätze mit geprüften Lizenzen;
  • das Annotationswerkzeug CVAT, für das Projekt bereitgestellt;
  • eine von einem Chirurgen genehmigte Annotationsrichtlinie;
  • eine Methode zur Qualitätskontrolle mit klaren Metriken.

Für Sie bleibt das, wofür Sie betreuen: die Fragestellung, die Methode und die Diskussion der Ergebnisse.

Lehrmaterial

Annotierte Operationsaufnahmen sind Anschauungsmaterial für topografische Anatomie, operative Chirurgie und Allgemeinchirurgie. Strukturen werden auf echten laparoskopischen Bildern umrandet und beschriftet, die Phasen der Operation auf einer Zeitleiste markiert. Im Unterricht können Sie eine Cholezystektomie vom Setzen der Trokare bis zur Entfernung der Gallenblase durchgehen und zeigen, wie die „Critical View of Safety“ aussieht.

Publikationen für den Fachbereich

Gemeinsame Artikel und Abstracts auf Basis offener Daten, mit reproduzierbarer Methode. Lehrende, die Studierende betreuen und Annotationen prüfen, werden auf Grundlage einer Beitragsvereinbarung Mitautoren.

Eine Expertenrolle

Erfahrene Chirurgen und Anatomen können Klassendefinitionen schärfen, strittige Bilder klären und die Annotationsrichtlinie prüfen. Das ist der klinische Bereich.

Internationaler Kontext

Forschungsgruppen auf der ganzen Welt nutzen die Datensätze des Projekts. Die Ergebnisse Ihrer Studierenden lassen sich mit veröffentlichten Arbeiten vergleichen, was eine gute Schule wissenschaftlicher Ehrlichkeit ist.

Ein Semester im Projekt: ein Beispielplan für eine Forschungsgruppe

Wochen Was passiert Ergebnis
1–2 Wie medizinische KI funktioniert, Datenethik und Lizenzen, die Annotationsrichtlinie CVAT-Konten, Richtlinie gelesen
3–4 Kalibrierung auf Bildern mit Referenzannotation Ein Bericht über die Übereinstimmung jeder/s Studierenden mit der Referenz
5–10 Echte Annotation, Peer-Review, strittige Bilder mit einem Chirurgen besprochen Akzeptierte Annotationsstunden
7–12 Eine kleine Studie zu einem der Themen Analyse, Abbildungen, Einschränkungen
13–16 Abstract und Vortrag schreiben Ein Abstract für eine studentische Konferenz

Der Plan lässt sich auf ein Modul von 4–6 Wochen verdichten oder auf ein akademisches Jahr strecken, das mit einer Abschlussarbeit endet.

Formen der Zusammenarbeit

  • Eine studentische Forschungsgruppe auf Basis des Projekts: drei oder mehr Studierende unter Ihrer Betreuung.
  • Seminar- und Abschlussarbeiten aus der Themenliste oder nach Ihren eigenen Ideen.
  • Gemeinsame Arbeit mit Informatikstudierenden: Die Medizinstudierenden verantworten den klinischen Sinn, die Informatikstudierenden das Modell und den Code. Themen für Zweierteams stehen in der Liste.
  • Ein Wahlfach „Künstliche Intelligenz in der Chirurgie“ mit praktischer Annotation; wir können den Lehrplan gemeinsam entwerfen.
  • Eine Hochschulpartnerschaft: eine Kooperationsvereinbarung. Siehe den Partnerschaftsbereich. Der Name einer Hochschule erscheint auf der Website nur mit deren schriftlicher Erlaubnis.

Was das Projekt übernimmt

  • CVAT-Konten und Einweisung in das Werkzeug;
  • fertige Aufgaben aus geprüften, de-identifizierten Daten;
  • Qualitätsmetriken für jede/n Studierende/n: Übereinstimmung mit der Referenz und mit anderen Annotierenden;
  • klinische Begutachtung strittiger Fälle;
  • Beratung zu Methoden, Statistik und Analysecode.

Was vorab zu klären ist

  • Ethik. Das Projekt holt für die Annotation offener, de-identifizierter Daten ein gesondertes schriftliches Gutachten ein. Umfasst eine Studie Befragungen, Lehrexperimente oder die Analyse der eigenen Leistungen von Studierenden, braucht sie die Genehmigung der Ethikkommission Ihrer Hochschule und die Einwilligung der Teilnehmenden.
  • Lizenzen. Die meisten Datensätze erlauben nur nicht kommerzielle Nutzung. Lehre und Forschung fallen darunter. Siehe die Lizenzseite.
  • Anerkennung. Nur die Hochschule kann die Arbeit im Projekt als Praktikum oder als Forschungsarbeit anrechnen. Auf Anfrage bestätigt das Projekt Umfang und Qualität der Arbeit jeder/s Studierenden.

So fangen Sie an

Schreiben Sie an support@opensurgicalvision.org mit dem Betreff „Department: cooperation“ (auf Englisch, damit das Team die Post sortieren kann). Nennen Sie die Hochschule, den Fachbereich, ungefähr wie viele Studierende und welches Format Sie interessiert. Wir antworten und schlagen einen Termin für ein kurzes Online-Treffen vor.

Studierende, die auf eigene Faust mitmachen möchten, haben eine eigene Seite. Lehrende an Technischen Hochschulen: Siehe den Abschnitt auf der Seite für Informatikstudierende.

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